Detalles de la búsqueda
1.
Spread of a SARS-CoV-2 variant through Europe in the summer of 2020.
Nature
; 595(7869): 707-712, 2021 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34098568
2.
Estimates of early outbreak-specific SARS-CoV-2 epidemiological parameters from genomic data.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 121(2): e2308125121, 2024 Jan 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38175864
3.
HIV co-infection is associated with reduced Mycobacterium tuberculosis transmissibility in sub-Saharan Africa.
PLoS Pathog
; 20(5): e1011675, 2024 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38696531
4.
Bayesian phylodynamics reveals the transmission dynamics of avian influenza A(H7N9) virus at the human-live bird market interface in China.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 120(17): e2215610120, 2023 04 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37068240
5.
Back-to-Africa introductions of Mycobacterium tuberculosis as the main cause of tuberculosis in Dar es Salaam, Tanzania.
PLoS Pathog
; 19(4): e1010893, 2023 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37014917
6.
Generative Bayesian modeling to nowcast the effective reproduction number from line list data with missing symptom onset dates.
PLoS Comput Biol
; 20(4): e1012021, 2024 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38626217
7.
Skyline Fossilized Birth-Death Model is Robust to Violations of Sampling Assumptions in Total-Evidence Dating.
Syst Biol
; 72(6): 1316-1336, 2023 Dec 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37605524
8.
Why are different estimates of the effective reproductive number so different? A case study on COVID-19 in Germany.
PLoS Comput Biol
; 19(11): e1011653, 2023 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38011276
9.
The origin and early spread of SARS-CoV-2 in Europe.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 118(9)2021 03 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33571105
10.
LAPIS is a fast web API for massive open virus sequencing data.
BMC Bioinformatics
; 24(1): 232, 2023 Jun 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37277732
11.
estimateR: an R package to estimate and monitor the effective reproductive number.
BMC Bioinformatics
; 24(1): 310, 2023 Aug 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37568078
12.
Joint Inference of Migration and Reassortment Patterns for Viruses with Segmented Genomes.
Mol Biol Evol
; 39(1)2022 01 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34893876
13.
A Phylogeny-aware GWAS Framework to Correct for Heritable Pathogen Effects on Infectious Disease Traits.
Mol Biol Evol
; 39(8)2022 08 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35921544
14.
CoV-Spectrum: analysis of globally shared SARS-CoV-2 data to identify and characterize new variants.
Bioinformatics
; 38(6): 1735-1737, 2022 03 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34954792
15.
The Occurrence Birth-Death Process for Combined-Evidence Analysis in Macroevolution and Epidemiology.
Syst Biol
; 71(6): 1440-1452, 2022 10 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35608305
16.
Bayesian inference of reassortment networks reveals fitness benefits of reassortment in human influenza viruses.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 117(29): 17104-17111, 2020 07 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32631984
17.
Investigation of an international water polo tournament in Czechia as a potential source for early introduction of the SARS-CoV-2 Omicron variant into Belgium, Switzerland and Germany, November 2021.
Euro Surveill
; 28(45)2023 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37943503
18.
DeepSARS: simultaneous diagnostic detection and genomic surveillance of SARS-CoV-2.
BMC Genomics
; 23(1): 289, 2022 Apr 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35410128
19.
TiDeTree: a Bayesian phylogenetic framework to estimate single-cell trees and population dynamic parameters from genetic lineage tracing data.
Proc Biol Sci
; 289(1986): 20221844, 2022 11 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36350216
20.
Characterising the epidemic spread of influenza A/H3N2 within a city through phylogenetics.
PLoS Pathog
; 16(11): e1008984, 2020 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33211775